Тропический пассатный с довольно резкими различиями в погодных условиях между районами страны. Сезонные изменения температуры невелики, однако прикарибское побережье и другие восточные области до высоты 800 м заметно теплее центральных районов и относятся к жаркой зоне "тьерра-кальенте", в то время как основная часть страны лежит в умеренно-жаркой зоне "тьерра-темплада", обладающей всеми признаками горного климата.
Реки Гондураса преимущественно горные, их истоки находятся в горах. Самые длинные из них – Улуа, Агуан и Патука. На многих реках можно встретить очень красивые водопады.
В Тегусигальпе и всех крупных городах есть вполне современные больницы и клиники.