Протяжённость границы с Китаем на севере и северо-западе составляет 470 км; протяжённость границы с Индией (со штатом Сикким на западе, Западной Бенгалией на юго-западе, Ассамом на юге и юго-востоке, и Аруначал-Прадеш (прежде Северо-Восточное пограничное агентство) на востоке составляет 605 км.

Индийский штат Сикким (территория шириной 88 км) отделяет Бутан от Непала, а индийский штат Западная Бенгалия — от Республики Бангладеш (причём расстояние от Бутана до Бангладеш всего 60 км).

Расстояние между восточной и западной границей Бутана — 300 км, между северной и южной — 170 км. Площадь государства — 46 500 км² (одна третья площади Непала).

В середине 1980-х годов приблизительно 70 % территории было покрыто лесами, 10 % — круглогодичным снегом и ледниками, почти 6 % — постоянно культивировалось или занималось населёнными пунктами, 3 % — временно культивировалось и 5 % — занималось лугами и пастбищами.

Остальная территория — скалистая местность, на которой невозможно культивирование сельскохозяйственных растений.

Первые британцы, побывавшие в Бутане, рассказывали: «Тёмные и узкие горные долины, вершины гор, затерянные в облаках, создают пейзаж исключительной роскоши и величественности».

Территория страны — одна из самых труднопроходимых горных местностей мира, высота которой меняется от 160 до 7000 м над уровнем моря. Высочайшая точка Бутана — гора Кулагангри (Kulha Gangri) высотой 7554 м (находится на севере страны на границе с Китаем).

Вторая высочайшая точка — Джомолхари (Chomo Lhari) высотой 7314 м (находится у долины Чумби (Chumbi). В стране насчитывается 19 горных пиков, превышающих высоту в 7000 м.

На севере бутанско-китайской границы возвышаются заснеженные гималайские пики высотой более 7500 м, на вершинах которых властвует арктический климат.

Вода горных рек, образовавшаяся в результате таяния ледников, долины в этом регионе создают идеальные условия для крупного рогатого скота, разводимого редким местным населением.

Чёрные Горы в центральной части Бутана образуют естественный водораздел между двумя главными речными системами страны — Мо (Mo Chhu) и Дрангме (или Манас)(Drangme Chhu).

Высота горных вершин Чёрных Гор — 1500—2700 м над уровнем моря, а бурные горные реки образовали горные ущелья. Лес в центральной части Бутана — огромная ценность страны. Восточный Бутан разделён южными вершинами горной системы Донга.

В западной части Бутана находятся плодородные культивируемые долины и водохранилища страны. Возвышенность Сивалик, Ю или Чёрные Горы, предгорье Гималаев, покрыта лесами, аллювиальными речными долинами и горами высотой до 1500 м над уровнем моря.

Возвышенность спускается в субтропическим равнинам «дуарам». Большая часть этой равнины лежит в Индии, но она проникает внутрь Бутана на 15 км.

Равнины «дуары» в Бутане состоят из 2 частей. Северная часть — пересечённая местность с сухой пористой землёй и обильной растительностью. Южная часть — плодородные земли, поросшие высокими травами и обширными джунглями.

На равнине выращивается рис и другие зерновые культуры. Важнейшие коммерческие центры страны — Пхунчхолинг (Phuntsholing), Гейлегпхуг (Geylegphug) и Самдруп-Джонкхар (Samdrup Jongkhar) — находятся именно на равнинах «дуарах». Здесь обитают тигры, леопарды, слоны и другие животные.