Конституция Боснии и Герцеговины предусматривает свободу вероисповедания.
Религиозное образование в Боснии и Герцеговине в значительной степени децентрализовано, как и система образования вообще.
Правительства Федерации Боснии и Герцеговины, Рспублики Сербской и власти округа Брчко несут ответственность за образование, каждое на подконтрольной территории, нет никакого общегосударственного министерства просвещения.
Общественные школы предоставляют религиозное образование, но за исключением Брчко, школы каждого кантона преподают основы доминирующей конфессии. Теоретически, студенты имеют право не посещать занятия, но практически в результате давления клерикальных преподавателей и пэров, студентам приходится посещать занятия.
Например, власти Республики Сербской требуют, чтобы сербы посещали занятия по религии, но не требует этого от боснийцев и хорватов.
Если более 20 боснийцев или хорватов посещают свою конфессиональную школу в РС, то школа обязана организовывать религиозные классы от их имени.
Однако, в сельских районах РС нет обычно никакого компетентного религиозного представителя, который мог бы преподавать религиозные дисциплины горстке хорватских или боснийских студентов.
То же самое происходит в Федерации, где студенты хорваты или боснийцы обязаны посещать религиозные занятия, в то время как сербам не обязательно их посещать.
В пяти кантонах Федерации с преобладающим боснийским населением, школы предлагают исламские религиозные занятия, в виде двухчасового еженедельного курса.