Также с 2006 года действует «Реформированная католическая церковь Венесуэлы». Её священниками являются клирики, запрещённые в служении католическими епископами за различные канонические нарушения.

 Вскоре к ним присоединился и бывший лютеранский пастор Энрике Альбонроз. Основной причиной мировой огласки стала предполагаемая поддержка президентом Венесуэлы Уго Чавесом, оказываемая новой церкви в противовес католической.

Церковь не требует от своих клириков обязательного целибата, не считает грехом гомосексуальность, допускает развод. Единственным обязательным правилом является полная поддержка социалистического проекта президента Чавеса, также Альбонроз не отказался и от почитания Мартина Лютера, а богослужения приобрели некоторые протестантские черты. Церковь (на лето 2008) состоит из пяти приходов в провинции Сулия.

Большинство протестантов страны — пятидесятники. Крупнейшей пятидесятнической деноминацией является Венесуэльские Ассамблеи Бога — 410 тыс. верующих. 

Пятидесятническое движение также представляют Объединенная пятидесятническая церковь, Церковь четырёхстороннего Евангелия, Церковь Бога, Вселенская церковь царства Божьего и др. Адвентисты насчитывают в своих рядах 197 тыс. верующих. Национальная баптистская конвенция объединяет 550 церквей и 45 тыс. верующих, плимутские братья — 23 тыс., лютеране — 7 тыс., Церковь Назарянина — 5 тыс.