Самым лучшим считается климат северной части острова Сан-Томе. Эта территория защищена от ветров, и дождей здесь бывает меньше. Правда, облачность всегда остается высокой.
Юг острова Сан-Томе, равно как и остров Принсипи, покрыт тропическими лесами и увлажнен гораздо больше. Лучшим временем для поездки в Сан-Томе и Принсипи является сухой сезон — с июня по сентябрь. Облачность по-прежнему высока, но влажность меньше, чем в остальное время года.
Круглый год должна быть легкой и желательно не из синтетики. В сезон дождей нужно захватить зонт.
Обязательна прививка против желтой лихорадки. Риск заражения малярией — круглый год. Насекомые активны круглый год, особенно ночью.